Opposition à un chèque

Bonsoir,

Ma banque peut-elle s'opposer à ma volonté de faire opposition à un chèque pour les raisons suivantes ?

Il semble que je sois la victime d'une entreprise mal intentionnée qui alors que j'étais dans un situation d'urgence (un dégât des eaux important sans possibilité de joindre les responsables de l'immeuble où je suis locataire) m'a obligé à leur remettre un chèque de caution d'un montant de 3 300,96€ en garantie du paiement de la facture établie au nom du gérant de l'immeuble. C'était la condition obligatoire pour qu'ils acceptent d'effectuer les travaux nécessaires pour arrêter l'inondation qui prenait de plus en plus d'ampleur.
A ce jour, le gestionnaire de l'immeuble (logements sociaux), société d'économie mixte, refuse de payer la facture sous prétexte que son montant est trop élevé et qu'elle est "l'oeuvre d'escrocs notoires" (dixit par téléphone). En conséquence, l'entreprise intervenante me menace de déposer le chèque de caution sur son compte. J'ai voulu hier y faire opposition mais ma conseillère de clientèle m'a dit que ce n'était possible qu'en cas de perte, de vol ou d'utilisation frauduleuse et qu'elle considérait que ce cas ne correspondait pas.
Est-ce à ma banque de porter un tel jugement ou puis-je insister pour faire opposition et avec quel motif ?