Je pense que l'employeur fait une confusion entre le fonctionnement du Comité d'Entreprise et celui des réunions des Délégués du Personnel.

L'ordre du jour du CE est établi conjointement par le président du CE (l'employeur) et secrétaire du CE (un salarié) : les autres membres du CE doivent donc passer par le secrétaire pour inscrire leurs questions.

Pour les réunions de Délégués du Personnel, il n'y a pas cette procédure : l'employeur reçoit directement les questions.
Pour couper court au problème, je vous suggère de ne plus envoyer de questions avant la réunion, mais de les poser directement lors de la réunion : il dispose alors de 6 jours pour vous répondre par écrit.

Non, les délégués du personnel doivent remettre leurs questions à l'employeur 2 jours avant la date prévue de la réunion, sinon, l'employeur ne sera pas tenu d'y répondre ni à la réunion, ni dans les 6 jours.

Il n'y a rien de prévu sur la forme de présentation des revendications. Ca peut être par liste, par syndicat, ou même chaque délégué à condition de respecter les 48 heures. Donc, vous faites ce qui vous arrange, point.

Maintenant, pour avoir un peu de cohérence, il est d'usage que les délégués groupent leurs demandes pour les présenter ensemble, lorsque c'est possible.