Ce n'est pas grave.
Voici les articles du Code du Travail concernant le 1er mai
article L3133-4 Le 1er mai est jour férié et chômé
article L3133-5 Le chômage du 1er mai ne peut être une cause de réduction de salaire.
article L3133-6 Dans les établissements et services qui, en raison de la nature de leur acrivité, ne peuvent interrompre le travail, les salariés ocuupés le 1er mai ont droit, en plus du salaire correspondant au travail accompli, à une indemnité égale au montant de ce salaire. Cette indemnité est à la charge de l'employeur.
A consulter sur legifrance.fr
Si vous n'avez pas travaillé et l'avez comptabiliser dans vos congés vous pouvez le récupérer. Le 1er mai ne doit pas être pris comme un CP et donc encore moins venir en déductionde vos CP.
Cordialement
Accident de travail congés payés