Calcul indemnités rupture conventionnelle avec arrêt maladie

Bonjour, j'ai rdv avec mon employeur pour négocier les conditions de la rupture conventionnelle ce 11 septembre
J'ai été engagée le 11/07/2014 à temps partiel pour un salaire brut mensuel de 826 €. J'ai été en arrêt maladie du 13/01/2015 au 20/04/2015 : rémunération par la Cpam sans complément de mon employeur.
Suite à de nombreux litiges sur les conditions de travail et malgré mes nombreuses propositions de négociations, j'ai pris le parti de ne pas retourner à mon poste compte tenu du comportement de mon employeur. Donc du 21/04/2015 à ce jour je suis en absences injustifiées, sans salaire bien évidemment.
Pourriez-vous me dire quel va être le mode de calcul de mon employeur afin de fixer l'indemnité légale de RC ?
J'ai lu sur le site emploi.gouv que l'employeur doit faire une simulation d'un brut mensuel même si l'employé n'a pas travaillé ?
Est-ce que l'employeur doit tenir compte dans son calcul des périodes indemnisées par la sécurité sociale ?
Je ne veux pas signer un accord sans être certaine de ce qui doit être pris en compte
Merci de votre réponse