Vente de fonds de commerce

Bonjour,
Mon mari est en âge de prendre sa retraite. artisan Travailleur indépendant affilié au RSI depuis 33 ans en nom propre
Il est toiletteur canin. Il y a 20 ans, il a acheté les murs du salon de toilettage.
S'il vend le fond de commerce et part à la retraite, la valeur des murs portée au bilan 38000 € avec amortissement,( intéressant à l'époque selon le comptable) vont "aller" dans nos biens perso.
Donc le RSI nous demandera environ 50% de 38000 €... Donc 15000 ou 16000 € !
Notre fond de commerce ne va peut être pas pouvoir se vendre plus.
On nous parle de SCI ? N'es ce pas trop tard ?
Notre comptable semble un peu perdu sur ces questions.
Pourrez vous nous éclairer ?
Merci d'avance