Paiement d'un arrêt de travail par la Sécu

Bonjour,
Je vous résume l'histoire de mon ami en quelques mots, car nous avons besoin d'aide, et personne n'arrive à nous renseigner!
Mon ami est en arrêt de travail (pas accident du travail, j'insiste bien) depuis environ 6 mois. Il est carrossier peintre, et son arrêt de travail est dû à des douleurs dorsales, qui sont elles, dues à un accident de circulation, il y a une dizaine d'années.
Il n'est par contre pas déclaré inapte à son poste, bien qu'il ne puisse plus travailler, tant les douleurs sont fortes. Sur les conseil de la médecine du travail, il est en train de faire un bilan de compétences, d'une durée de 3 mois, afin de "trouver" un nouveau métier.
Cependant, son médecin traitant à demandé un contrôle du médecin conseil de la Sécu. Et à la suite de ce contrôle, mon ami a reçu un courrier émanent de la Sécu, lui notifiant qu'il ne serait plus payé à partir du 16/04/2011. Le médecin, lui, de son côté, n'a reconduit l'arrêt de travail que jusqu'au 16/04/2011 également.
Sachant que mon ami n'est plus capable s'assurer son poste, que doit il faire? Qui va le payer?
Je vous remercie beaucoup de l'aide que vous pourrez m'apporter, en répondant, si vous le pouvez, à ma question.
Bonne journée à tous.