Rupture de contrat

Bonjour,
Je suis en interim dans une société depuis janvier et mon contrat est renouvelé régulièrement. Le dernier se termine le 30 septembre. J'ai de très mauvais rapports avec ma collègue et je ne me sens pas capable d'aller travailler. Je pense me mettre en arrêt de maladie. Mes questions : est-ce que je peux m'arrêter jusqu'à la fin de mission en maladie ?
Vais-je perdre mes IFC? Et mon droit chômage ?
Sinon quelle autre solution ai-je ?
Merci