Bail 3/6/9 problème

Bonjour,
je suis un jeune créateur d'entreprise, j'ai créer ma société en 2005, je suis spécialisée dans le domaine des arts martiaux et sports de combat.
En Décembre 2007, je décide d'élargir le champ d'activité de mon entreprise en ouvrant un magasin dans ma région "Annecy". je me mets donc a la recherche d'un local commercial. je le trouve et je signe avec mon propriètaire un bail commercial en 3/6/9.

A la signature, le propriétaire me fait savoir que si j'ai le moindre problème, de n'importe quel ordre, je dois lui en faire part.
En Janvier 2008, suite à cette conversation, je lui fait part par oral de mes difficultés financières, et que j'envisage de partir pour ne pas lui causer de problème concernant le paiement de ces futurs loyers.
Je pensais que mon entreprise allait reprendre le dessus financièrement, mais cela n'a pas été le cas.
En Février je lui fait donc une lettre recommandée AR lui stipulant que mon souhait était de partir le plus vite possible, le 15 Mars, car mes problèmes financiers s'aggravaient. Je lui rappel dans ce recommandée ces propres propos que d'un comme un accord je souhaitais mettre fin au bail pour éviter tout problème pour le paiement de son loyer.

Il était d'accord.
Au moment de rendre les clefs, il me redonna la caution de garantie que mes parents avaient donnés, mais refusa de me rendre la caution de deux mois que j'avais versée à la signature du bail.
Ensuite je reçois une lettre recommandée où un chèque avait pris place, mais ce chèque était d'un tiers de ma caution.
Au jour d'aujourd'hui mon ancien propriétaire refuse de me rendre le reste, sous prétexte que je ne l'ai pas prévenu a temps, ce que je ne pouvais pas faire puisque 6 mois avant mon entreprise allait à peut prés bien.

De plus il fait valoir le fait que à la signature il ma fait cadeaux d'une certaine somme pour la mise en place correspondant a un demi mois de loyer, l'accord était que je devais remettre le local en état donc ou est ce cadeaux.

Aujourd'hui je suis dans une impasse, et je voudrais récupérer ma caution? Quels sont les recours dont je dispose?
Pouvez vous m'aider s'il vous plaît, j'ai deja du mal à démarrer mon entreprise, et cette somme d'argent est considérable pour moi.

Merci.
Cordialement.