Absentéisme à la maternelle de mon fils

Bonjour,
Alors voilà mon problème et je suis complètement perdue... mon fils a 5 ans et depuis le début de l'année il a plusieurs absence ( son Papa n'a que le lundi et le mardi de repos et donc les seuls jours où il peux profiter de ses enfants ). Sachant que l'école est obligatoire à partir de 6 ans nous nous disions que ce n'était pas trop grave. Seulement voilà sa maîtresse nous a "menacer" d'envoyer une lettre au rectorat pour ses absences. Donc il y est tous les jours car je n'ai pas envie d'avoir de problèmes. Mais je ne comprend pas car dans la loi l'école est obligatoire à partir de 6 ans ma question est : à t'elle le droit de nous mettre une telle pression? Merci pour vos réponse car ça me cause beaucoup de souci et de stress!!